Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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