Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LETMD1Q6P1Q0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms