Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms