Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms