Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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C9orf135Q5VTT2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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