Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01545Q5VT33 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms