Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms