Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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