Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PERM1Q5SV97 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms