Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHOD3Q2V2M9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms