Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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