Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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EXT1Q16394 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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