Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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