Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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