Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms