Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms