Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms