Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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TLR1Q15399 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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