Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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