Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms