Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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COL4A6Q14031 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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