Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms