Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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