Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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