Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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TCIRG1Q13488 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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