Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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ITGB3BPQ13352 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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