Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RLFQ13129 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLFQ13129 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLFQ13129 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLFQ13129 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLFQ13129 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLFQ13129 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLFQ13129 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLFQ13129 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLFQ13129 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLFQ13129 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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