Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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