Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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