Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPN13Q12923 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPN13Q12923 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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