Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms