Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms