Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms