Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNG1Q06432 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms