Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms