Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms