Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC066613.2-201ENST00000561007 560 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC011939.1-201ENST00000567680 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms