Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms