Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms