Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF3P78545 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms