Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKP1P63208 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SKP1P63208 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKP1P63208 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms