Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms