Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms