Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms