Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.4 ms