Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN8P56748 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN8P56748 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms