Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA2P51531 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms