Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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