Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.3 ms