Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NESP48681 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NESP48681 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NESP48681 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NESP48681 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NESP48681 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms